時は西暦2999年、AIの革新により万物が知性を持つ生き物として存在していた。2000年代最後の年に納豆として生まれたヒロシは、納豆としての普通の青春を送りながらも、自分の存在意義を問うていた。そんな彼は、捕食者である人間と戦うことを決意する。愛する納豆たちを守るため、今、ヒロシは立ち上がる。